Jim Chee (Kiowa Gordon), un aspirante a agente encubierto del FBI, renunció a sus ambiciones de abandonar la reserva y renunció después de exponer a su corrupto jefe. Chee, que recientemente sufrió una amarga ruptura con Manuelito, ahora trabaja en Arizona y la reserva como investigador privado. Mientras tanto, Joe y Emma han dado la bienvenida a la madre soltera adolescente Sally Growing Thunder (Elva Guerra) para que viva con ellos y los ayude a criar a su bebé.
¿Cómo comienza la temporada 2?
Mientras estaba en el hospital, Emma resulta herida por una explosión masiva en el estacionamiento, que mata al paciente con cáncer terminal Emerson Charley mientras intenta acceder a su automóvil. Aunque inicialmente se asumió que fue una explosión accidental de una línea de combustible, Leaphorn rápidamente deduce que fue obra de una bomba al investigar la escena. Al otro lado de la ciudad, Chee es contratada por Rosemary Vines (Jeri Ryan) para recuperar una caja robada a su rico marido BJ (John Diehl), un magnate de los negocios local que adquirió el sitio de perforación donde Leaphorn perdió a su hijo después de la tragedia.
La búsqueda de Chee lo lleva a reunirse con Leaphorn, y los dos hombres rastrean la caja hasta una parte remota del desierto donde son atacados por un pistolero llamado Colton Wolf. Leaphorn identifica a Wolf como el atacante antes de escapar y se da cuenta de que Wolf estaba quemando el contenido de la caja, y se sorprende de que la hebilla del cinturón de su difunto hijo estuviera incluida en ella. Wolf procede a asesinar al hijo de Emerson, Tomas Charley (Robert I. Mesa), casi mata al hijo de Tomas, Benny (Jet James Grant), y resulta herido en un intento de asesinato de Chee mientras este último se recupera en el hospital de un disparo en el tiroteo anterior. . En su fuga, Wolf asesina a un guardia de seguridad y a un policía, además de a una mujer navajo que lo cuida, ajena a sus tendencias asesinas.
Mientras Leaphorn estudia los bombardeos más de cerca, descubre que la explosión en el lugar de perforación no solo fue obra de una bomba diseñada de manera similar, sino que Wolf también fue el bombardero responsable. Al profundizar más, Leaphorn se da cuenta de que Wolf llevó a cabo el atentado que se cobró la vida de su hijo bajo las órdenes de un misterioso benefactor. Al perseguir a Wolf por el desierto, Leaphorn lo detiene con éxito y lo pone bajo custodia policial, no sin antes romperse gravemente la muñeca después de saltar por un barranco como parte de la persecución.
A lo largo de la temporada, Wolf contrata a una serie de investigadores privados para localizar a su madre perdida hace mucho tiempo y los asesina cuando no tienen éxito. Un flashback de la infancia de Wolf muestra a su madre matando a su padre y a su hermana mayor en un ataque violento antes de que el joven Wolf la mate él mismo. Esto no solo muestra cuán trastornado está Wolf, que todavía la buscaría décadas después, sino que mantiene un ritmo similar al de un metrónomo en sus momentos de tranquilidad para que coincida con un metrónomo desatendido en la casa cuando descubrió que su familia fue asesinada.
¿Quién está realmente detrás de los atentados?
Después de escapar de la custodia policial de camino a una cárcel fuera de la reserva, Wolf huye a la casa de su benefactor, que se revela como BJ Vines. Después de que Wolf le asegura que su conexión sigue siendo un secreto, Vines lo ejecuta para eliminar al último conspirador conocido. Cuatro años antes, el difunto hermano de Emerson, Dylan, le proporcionó a Vines un informe geológico que revelaba que se encontraba una veta de uranio en la propiedad donde se encontraba el sitio de perforación. Vines contrató a Wolf para bombardear el sitio y hacerlo parecer un accidente para reducir drásticamente el valor del terreno y facilitarle la compra, guardando el informe geológico en su caja junto con la hebilla del cinturón como un trofeo retorcido.