Los deja atrás. Si bien la película comienza con una emocionante escena occidental de los juguetes en el apogeo de los poderes imaginativos de Andy, eso es solo un prólogo. Pasa a la actualidad acompañada de una versión distorsionada de la canción clásica de Randy Newman para la primera película, «You’ve Got a Friend In Me». Donde los juguetes alguna vez se colocaron perpetuamente en el piso de Andy, ahora no se encuentran por ningún lado. Muchos han desaparecido, dejando solo a Woody, Buzz, Jessie (Joan Cusack), Mr. Potato Head (Don Rickles) y un puñado más.
Con Andy a punto de irse a la universidad, tiene poco interés en los juguetes viejos, hecho que los ha desilusionado. Cuando todos menos Woody son arrojados a una bolsa de basura para su almacenamiento, lo toman como una señal de que realmente están fuera. Y cuando la mamá de Andy piensa que la bolsa es solo basura y la deja con basura, un camión los recoge. Woody finalmente se reúne con los demás, tratando de que regresen a la casa de Andy. En el proceso, todos terminan en una guardería, lo que refleja una especie de ciclo de vida para los juguetes: tienen suerte de ser amados por un niño que eventualmente los supera, obligándolos a ser irrelevantes hasta que, tal vez, algún otro niño los encuentra
Al principio, la guardería parece un paraíso para los juguetes, ya que en sus cabezas crece la idea de que siempre habrá niños que quieran jugar con ellos. Eso es ciertamente lo que el jefe de los juguetes de la guardería, un osito de peluche rosado y esponjoso llamado Lots-O’-Huggin’ Bear (Ned Beatty), quiere que piensen.