Si bien Robert Shaye comenzó a relajarse al ver lo que Peter Jackson y su equipo estaban haciendo con los $ 300 millones de New Line, eso estaba lejos de ser el final de las tensiones en «El Señor de los Anillos». A medida que continuaba el rodaje, el proyecto comenzó a superar su presupuesto inicial, para gran preocupación de los productores de las películas. Jackson, hablando con Deadline, dijo que era «comprensible» que Shaye y sus compañeros ejecutivos quisieran tratar de controlar sus gastos. «Ellos no son los malos en esta historia; nosotros somos realmente los malos por excedernos en el presupuesto», agregó.
Jackson continuó, afirmando que las cosas comenzaron a estabilizarse cuando el productor Barrie Osborne llegó después de unos meses de filmación, momento en el que toda la trilogía fue «re-presupuestada y realista». En ese momento, sin embargo, confesó: «Todos nos sentimos un poco asediados». Las cosas eventualmente llegaron a un punto crítico mientras Jackson estaba filmando la inmensamente complicada batalla de Helm’s Deep de «The Two Towers», durante un período en el que New Line «estaba más enojado con nosotros en términos de presupuesto», recordó el director. Específicamente, Jackson se encontró en desacuerdo con el difunto Michael Lynne, el entonces presidente y director de operaciones de New Line.