Después de que el final de la temporada 3 demostró que la serie podía manejar material más oscuro, la temporada 4 aumentó las apuestas antes de que Yin y Yang hicieran su segunda aparición. El episodio «Shawn toma un tiro en la oscuridad», que cuenta con las estrellas invitadas Michael Rooker (Guardianes de la Galaxia) y John Hawkes (True Detective: País nocturno) como los malos, ve a Shawn en verdadero peligro debido a un caso. Este episodio no es la primera vez que Shawn es apuntado con una pistola ni es la primera vez que se mete en problemas husmeando, pero es la primera vez que le disparan y lo secuestran.
Además de tener que salvar a su madre de un asesino en serie la temporada anterior, esto es lo más vulnerable que ha sido Shawn al resolver un caso. Depende de Gus, Lassiter (Timothy Omundson), Henry (Corbin Bersen) y Juliet seguir el rastro que Shawn ha estado dejando e intentar encontrarlo antes de que se desangre o los malos decidan terminar el trabajo. Shawn realmente sólo puede esperar que las habilidades que su padre le enseñó cuando era niño, como patear una luz trasera, sean suficientes para salvarlo.
Cuando Yin y Yang finalmente salen de escena después de la temporada 5, el programa decide que es el momento perfecto para poner a Henry, el padre de Shawn, en peligro. Los episodios “Santabarbaratown” y “Santabarbaratown 2” ven la reapertura de un caso en el que Henry trabajó cuando estaba en la policía. A medida que salen a la luz nuevas pruebas, Henry se da cuenta de que sus antiguos socios, incluido Jerry Carp (Max Gail), estaban sucios y involucrados en encubrir esta evidencia en primer lugar. Cuando Henry va a enfrentarse a Carp, su ex compañero le dispara y lo dan por muerto.
Shawn tiene que encontrar una manera de controlar su ira y el miedo de perder a su padre para poder encontrar a Carp antes de que desaparezca para siempre. Incluso después de todo lo que pasó con Yin y Yang, este podría ser el momento más enojado que jamás hayamos visto en Shawn. Con ellos era más fácil compartimentar. Eran claramente autores intelectuales criminales. Con Carp, sin embargo, es más difícil reprimir esos sentimientos porque es un hombre en el que Henry alguna vez confió. Es una traición que hiere más profundamente y aumenta los riesgos.