En «Mutant Mayhem», no se mezclan las tortugas, no hay dudas sobre cuál es cuál. Esto se debe en gran parte al equipo de animación de personajes y al elenco de voces que hacen de cada Tortuga un individuo completamente único con una fuerte personalidad, como los problemas de ira de Ralph y el comportamiento más reservado y tímido de Donnie.
Pero son los diseños de personajes los que hacen que los personajes se destaquen. Ralph no es solo el chico malo del grupo, es el más grande de las Tortugas, un tipo más musculoso con destreza física que probablemente no ayude a controlar su ira. Mientras tanto, Mikey es muy escuálido y tiene frenos (no preguntes cómo se los ponen). Las personalidades de las Tortugas informan su apariencia, lo que a su vez informa cómo se comportan. Aunque hemos tenido tortugas con personalidades individuales durante décadas, los diseños aquí los hacen aún más únicos y como verdaderos individuos en lugar de variaciones ligeramente diferentes entre sí.
De hecho, el aspecto de «Mutant Mayhem» es diferente a lo que hemos visto en versiones anteriores de «TMNT». El director Jeff Rowe describió el estilo de la película como si fuera un trabajo conceptual, y dijo que querían que el estilo se viera «incompleto, imperfecto, deforme y que recordara la forma en que dibujas cuando eres un niño o un adolescente». La mayoría de los personajes se ven asimétricos, toscos, más como mutantes reales en el caso de la pandilla de Superfly, que son un poco desagradables y también tontos. También vemos eso en las propias Tortugas, que todavía son adolescentes en crecimiento.