Un grupo de investigadores internacionales independientes ha publicado su análisis completo de los datos metagenómicos recientemente descubiertos recopilados por los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades de China en enero y febrero de 2020. Los datos vinculan estrechamente el SARS-CoV-2 con las huellas genéticas de los animales salvajes. particularmente perros mapaches vendidos en el mercado mayorista de mariscos de Huanan en Wuhan, China, el epicentro inicial de la pandemia de COVID-19, dice el análisis del grupo.
El análisis completo proporciona evidencia convincente adicional de que el coronavirus pandémico saltó a los humanos a través de un contagio natural, con un animal salvaje en el mercado que actúa como huésped intermedio entre el reservorio natural del virus en los murciélagos de herradura y los humanos. Fue escrito por 19 científicos, dirigidos por Michael Worobey, biólogo evolutivo de la Universidad de Arizona; Kristian Andersen, virólogo del Instituto de Investigación Scripps en California; y Florence Débarre, teórica especializada en biología evolutiva en la agencia nacional de investigación de Francia, CNRS.
Antes de la publicación del análisis completo el lunes por la noche, la información sobre los hallazgos solo se hizo pública a través de informes de los medios y declaraciones de la Organización Mundial de la Salud, que recibió información sobre el análisis la semana pasada. Pero, los datos metagenómicos sin procesar detrás del análisis aún no están disponibles públicamente. Se publicó brevemente en una base de datos genética pública llamada Iniciativa global para compartir datos sobre la influenza aviar (GISAID) tan recientemente como a principios de este mes, y los investigadores internacionales pudieron descargarlo durante esa ventana de disponibilidad. Pero los administradores de la base de datos eliminaron rápidamente los datos después de su descubrimiento, diciendo que la eliminación fue a pedido del remitente, un investigador de los CDC de China.
datos oscuros
Desde entonces, los investigadores de los CDC de China han indicado a los investigadores internacionales y a la OMS que tienen la intención de compartir los datos, que respaldan un manuscrito científico que actualmente se encuentra en revisión por pares en una revista científica. Pero los investigadores internacionales señalan que no hay un cronograma para la publicación de los datos o planes establecidos si su manuscrito no es aceptado para su publicación.
A lo largo de la pandemia, los esfuerzos para investigar los orígenes del SARS-CoV-2 se han visto frustrados por las obstrucciones de China, que mantiene una hipótesis sin fundamento de que el virus se originó fuera de sus fronteras.
En comentarios introductorios al análisis recién publicado, los investigadores argumentan que, si bien cumplen con los términos de uso de GISAID, hace mucho tiempo que estos datos deben estar disponibles para el público y la comunidad científica. Pidieron tanto a GISAID como a sus colegas en China que lo pusieran a disposición.
«Los términos de uso de GISAID no excluyen la discusión pública de los datos siempre que se reconozca a los generadores de datos y se hayan hecho los mejores esfuerzos para colaborar con los contribuyentes», escribieron en defensa de la publicación de su análisis completo. «CCDC [China CDC] hasta ahora se ha negado a colaborar en esto. Respetamos el derecho de nuestros colegas de CCDC de ser los primeros en publicar un manuscrito con sus propios datos y no planeamos enviar un artículo que compita con su manuscrito que actualmente se encuentra en revisión». datos genéticos de la vista del público en medio de la revisión por pares, la base de datos esencialmente otorga a los CDC de China un embargo, lo que es una desviación de la misión declarada de GISAID de superar rápidamente tales obstáculos para compartir datos virológicos.
«Se recolectaron muestras del mercado de Huanan en enero y febrero de 2020 y, dada su importancia para comprender el origen de la pandemia, creemos que ha pasado una cantidad de tiempo irrazonable», escribieron los investigadores.
Contexto de datos
También destacaron que los datos metagenómicos publicados brevemente en GISAID no son la totalidad de los datos genéticos que tiene China CDC, que no ha compartido con la comunidad internacional. Los datos metagenómicos de otras muestras de mercado aún no se han visto públicamente, señalan.
Sin embargo, los datos que el grupo ha podido tener en sus manos hasta ahora pintan una imagen casi completa de cómo comenzó la devastadora pandemia. Los datos metagenómicos provinieron de alrededor de 50 archivos de datos, que se enumeran en el apéndice B del análisis, pero actualmente no están disponibles públicamente. Los datos son secuencias metagenómicas de algunos de los hisopos y muestras de aguas residuales que los CDC de China recopilaron en el mercado de Huanan después de que se cerrara el 1 de enero de 2020. Estos hisopos se informaron anteriormente; En febrero de 2022, los investigadores de los CDC de China publicaron un estudio preliminar sobre 1380 muestras ambientales y animales tomadas del mercado.
El estudio preliminar fue dirigido por George Gao, entonces director de China CDC. Indicó que los hisopos ambientales dieron positivo para SARS-CoV-2 y contenían material genético humano, pero que los hisopos de animales en el mercado, incluidos en su mayoría conejos, gatos callejeros, serpientes y erizos, dieron negativo. Dados esos hallazgos, Gao y sus colegas concluyeron que los humanos, no los animales, trajeron el virus al gran mercado, que luego actuó como un amplificador de la infección debido a la gran cantidad de personas que visitaban el mercado diariamente. China sugirió anteriormente que el virus se introdujo en el país a través de alimentos congelados importados vendidos en el mercado.
Aún así, los datos previos a la impresión indicaron que las muestras positivas para SARS-CoV-2 se encontraban predominantemente en la zona suroeste del mercado, donde se vendían mamíferos vivos. Desde entonces, otras investigaciones han encontrado lo mismo, incluido el estudio conjunto OMS-China y un análisis publicado en julio pasado en Science por Worobey y sus colegas. En la Figura 4 del artículo de Science, Worobey y sus coautores mostraron que la esquina suroeste del mercado tenía la mayor densidad de muestras ambientales positivas para SARS-CoV-2 y también era donde se guardaban los mamíferos salvajes vendidos ilegalmente. Eso incluye perros mapaches, uno de los cuales fue fotografiado en 2014 por uno de los autores del estudio, Edward Holmes, biólogo de la Universidad de Sydney. El estudio también encontró que algunos de los primeros casos humanos de COVID-19 se agruparon en la parte occidental del mercado, alrededor de donde se alojaban los animales vivos.