Científicos chinos publicaron su tan esperado análisis genético de las muestras y los hisopos que recolectaron a principios de 2020 del mercado de mariscos de Huanan, el epicentro inicial de la pandemia.
En el estudio, publicado el miércoles en Nature, los autores reconocen por primera vez que la vida silvestre susceptible a la infección por SARS-CoV-2, incluidos los perros mapaches, estaban presentes en el mercado en medio de la gran cantidad de rastros genéticos del SARS-CoV-2 y los humanos. . Pero el análisis general es erróneo e indica la presencia de animales que casi con seguridad no estaban en el mercado, incluidos los pandas gigantes, los chimpancés y las focas grises del Atlántico. Los autores continuaron minimizando la posibilidad de que un contagio del virus de la vida silvestre a los humanos en el mercado abarrotado fuera la chispa que encendió la pandemia. En cambio, presentaron repetidamente, sin evidencia, hipótesis favorecidas por los funcionarios chinos, a saber, que el virus se introdujo en el mercado a través de humanos o alimentos congelados, y el bullicioso lugar se convirtió en un sitio amplificador para la infección.
Aún así, la publicación de los datos es trascendental y tardará mucho en llegar. Aunque las muestras se recolectaron del 1 de enero al 30 de marzo de 2020, un borrador del estudio y alguno de los datos solo se publicaron por primera vez en una preimpresión dos años después, en febrero de 2022. La preimpresión informó que el SARS-CoV-2 abundaba en medio del material genético humano de las muestras, lo que indica que el virus prevalecía entre las personas en el mercado antes. fue cerrado en la mañana del 1 de enero. Los autores, dirigidos por científicos de los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades de China (China CDC), señalaron que también habían probado algunos animales en el mercado, en su mayoría conejos, gatos callejeros y serpientes, pero todos dieron negativo para SARS-CoV-2.
datos retenidos
No fue hasta el mes pasado, tres años después de que se recolectaron las muestras, que salió a la luz más información genética de esas muestras. En preparación para la publicación en Nature, los científicos de los CDC de China cargaron silenciosamente datos metagenómicos no revelados previamente de las muestras en una base de datos genética pública, llamada GISAID, en algún momento de enero. A principios de marzo, un grupo de científicos internacionales independientes notó los datos, los descargaron con entusiasmo y comenzaron a analizarlos mientras se comunicaban con los científicos de los CDC de China sobre una posible colaboración. Los científicos de los CDC de China respondieron haciendo que sus datos quedaran fuera de la vista del público, y GISAID acusó públicamente a los investigadores internacionales de incumplir los términos de servicio, que han negado enfáticamente.
Sin embargo, en medio de la disputa por el acceso a los datos, el grupo internacional publicó un análisis preliminar de los datos, sin publicar los datos genéticos subyacentes para evitar «recolectar» a sus colegas chinos. En general, ese análisis preliminar mostró que las muestras ambientales del mercado no solo eran positivas para el SARS-CoV-2 y el material genético humano, como sugería la preimpresión de 2022, sino que también estaban repletas de rastros genéticos de la vida silvestre, incluidos algunos que se sabe que son susceptibles. a las infecciones por SARS-CoV-2, como los perros mapaches.
El estudio, dirigido por Michael Worobey, biólogo evolutivo de la Universidad de Arizona; Kristian Andersen, virólogo del Instituto de Investigación Scripps en California; y Florence Débarre, teórica que se especializa en biología evolutiva en la agencia nacional de investigación de Francia, CNRS, proporcionaron la primera evidencia genética que vincula muestras positivas para SARS-CoV-2, humanos y animales salvajes susceptibles en el mercado.
El análisis no puede determinar si los animales estaban infectados con el virus pandémico o, si lo estaban, si se produjo alguna transmisión de animal a humano o de humano a animal. Por lo tanto, no puede determinar de manera concluyente cómo comenzó la pandemia. Sin embargo, como muchos virólogos y expertos en enfermedades infecciosas han señalado desde entonces, si un evento de contagio natural desencadenó la pandemia, esta estrecha mezcla de material genético en un mercado sospechoso en el epicentro de los primeros casos es exactamente el tipo de evidencia genética que los científicos esperarían encontrar. encontrar después del hecho. Se sabe que estos mercados, con una colección de animales salvajes en condiciones cerradas y abarrotadas de humanos, actúan como semilleros de riesgo para la adaptación viral y los efectos secundarios.
En particular, Worobey y sus colegas se centraron en una muestra de un carrito, Q61 o env_0576, que estaba rodeada por una alta densidad de muestras positivas de SARS-CoV-2 y, en sí misma, estaba repleta de material genético de perro mapache. Los investigadores encontraron que la muestra contenía 1.252 fragmentos genéticos con una identidad del 100 por ciento con el genoma del perro mapache sin coincidencias tan perfectas con el genoma humano. El hallazgo sugiere la posibilidad de que el SARS-CoV-2 presente fuera del perro mapache, no de los humanos.