En un episodio notable de «Star Trek: The Next Generation» llamado «¿Quién vigila a los vigilantes?» (16 de octubre de 1989), un puesto avanzado de estudio de la Federación disfrazado se expone accidentalmente a los extranjeros locales, entonces solo en un estado agrario de su desarrollo. Se explica que estos alienígenas ya han abandonado a los dioses, han adoptado la lógica y la observación como preferibles y, como resultado, es probable que se desarrollen rápidamente. Cuando uno de ellos resulta herido por la tecnología de la Federación, lo sedan y lo llevan a bordo del Enterprise, donde ven al Capitán Picard (Patrick Stewart) en una neblina anestesiada. Esto hace que empiece a creer que Picard es un dios, y se necesita la máxima diplomacia para que Picard se acerque a la tribu y les explique que es un mortal como ellos. Está dispuesto a recibir una flecha en el pecho y morir para probar su punto. La vida de Picard es menos importante que asegurar que esta especie no comience el mal hábito de la adoración.
Esto, por supuesto, no quiere decir que la religión esté completamente ausente de «Star Trek». En «Deep Space Nine», el pueblo bajorano tiene una religión politeísta compleja centrada en los profetas, deidades cuyas descripciones coinciden con una especie de extraterrestres no corpóreos que viven en un agujero de gusano estable sobre su planeta. En ese programa, las personas a menudo se dejan llevar por las visiones y el capitán Sisko (Avery Brooks) se convierte de mala gana en el emisario bajorano, un destino que eventualmente abrazará. Los dioses son esencialmente reales en «Deep Space Nine».
Sin embargo, mientras que los bajoranos son personas religiosas, gran parte de su iglesia se describe como corrupta y hambrienta de poder, ansiosa por establecer una teocracia durante un período de reconstrucción planetaria. La fe es importante, dice «Deep Space Nine», pero las iglesias, al parecer, no lo son.