Cuando Stan Lee y Jack Kirby crearon por primera vez a los X-Men para Marvel Comics a principios de los años 60, se burlaban deliberadamente del creciente movimiento por los derechos civiles, creando personajes como el «Profesor X», Charles Xavier (interpretado en la película por Patrick Stewart ) y Magneto, también conocido como Erik Lehnsherr, como análogos de cómics para figuras como el Dr. Martin Luther King, Jr. y Malcolm X.
La adaptación cinematográfica de 2000 continúa esta tradición mantenida desde hace mucho tiempo por los cómics, presentando a los mutantes y los X-Men como un resultado natural de la evolución. A pesar de sus variadas y, en algunos casos, habilidades naturales altamente destructivas, los mutantes esencialmente piden ser aceptados y se les permite integrarse en la sociedad humana, algo contra lo que los humanos temerosos y prejuiciosos están totalmente en contra o, en el mejor de los casos, desconfían.
Magneto, quien se reveló que alguna vez fue colega del profesor Xavier y con él esperaba una solución más pacífica al problema de los mutantes, creció prisionero de los nazis en el campo de concentración de Auschwitz, dejándolo con poco amor por la humanidad y una desconfianza de su capacidad de tolerancia. Por lo tanto, él y su Hermandad de Mutantes planean usar una máquina que genera un campo radiactivo especial que inducirá mutaciones en los humanos, obligando esencialmente a todos a ser iguales.
Desafortunadamente, Magneto no puede (o no quiere) ver que este plan es fascista en sí mismo, lo que lo hace no mejor que los hombres malvados que lo encarcelaron cuando era niño. Al final, el plan de Magneto es frustrado por el equipo mutante de X-Men, deteniendo al villano y destruyendo su máquina en la ubicación no coincidente de la Estatua de la Libertad, en sí misma un símbolo de aceptación.