Aunque podría decirse que Jessica fue la coprotagonista del primer libro, pasa la totalidad de «Dune: Messiah» relajándose en su planeta natal de Caladan y (supuestamente) relacionándose con Gurney Halleck. Durante este período, aparentemente no le preocupa toda la culpa y el temor existencial que enfrentan su hijo y su hija en Arrakis. Básicamente está jubilada, aunque mantiene una relación cordial con los demás miembros de la Bene Gesserit.
Jessica sólo vuelve a la narrativa en el tercer libro, «Children of Dune». En este punto, Paul ha abdicado del trono y se ha perdido ciego en el desierto, dejando a su hermana, la ahora adulta Alia, a cargo de gobernar hasta que los hijos de Paul, los gemelos Leto II y Ghanima, alcancen la mayoría de edad. El problema es que Alia se ha vuelto tiránica y loca por el picante a estas alturas, y Jessica tiene que descubrir qué hacer con la situación. Ella cree que Alia está demasiado lejos, que es una monstruosidad que necesita ser eliminada, pero Jessica también es plenamente consciente de que los problemas de Alia son prácticamente enteramente su culpa. Después de todo, Jessica bebió el Agua de la Vida a pesar de saber que estaba embarazada, y luego dejó a su hija durante años en lugar de quedarse y guiarla en la dirección correcta.
El arco del personaje de Jessica en «Children of Dune» refleja el arco de Paul en «Messiah», en el sentido de que ambos se ven obligados a considerar las consecuencias naturales de las decisiones que tomaron en «Dune». Paul tiene que aceptar que su ascensión al trono lo ha llevado a convertirse básicamente en un Hitler espacial, y Jessica tiene que enfrentar el hecho de que convirtió a su hija en una monstruosidad y luego la abandonó para caer en una espiral de locura paranoica.