Cuando Kishimoto dibujó por primera vez «Naruto» como un manga one-shot en 1997, pintó al protagonista como un alborotador alborotador que no está interesado en ir a la escuela. Sin embargo, después de que el one-shot se tradujera en una serie de manga semanal en 1999, Kishimoto agregó patetismo y profundidad a la infancia de Naruto. Si bien Naruto todavía era un mocoso cabeza de chorlito, ahora tenía el espíritu del zorro de nueve colas sellado dentro de él, lo que llevó a la aldea a evitarlo por completo. Al crecer como huérfano, Naruto pasó la mayor parte de su tiempo haciendo bromas y destruyendo las propiedades de la aldea en un intento por obtener el amor/atención que anhelaba desesperadamente.
En la entrevista de Shonen Jump (a través de NarutoHQ) mencionada anteriormente, Kishimoto habló sobre cómo su infancia «no fue tan feliz» y cómo a menudo se sentía como un extraño en la escuela, lo que se refleja en la historia de Naruto:
“Mi infancia no fue tan feliz… Como cualquier persona, he tenido dificultades en mi vida. No era el centro de atención de nadie en la escuela, más bien me sentaba en las afueras. No me fue bien en todo No sobresalí en los estudios ni en los deportes. Así que puedo entender los sentimientos de Naruto acerca de ser un desvalido».
Naruto emerge como el último desvalido, que es quizás una de las razones por las que los fanáticos del manga/anime lo encuentran tan identificable e inspirador. Incluso después de que sus compañeros y mayores se burlaran de él, Naruto promete esforzarse más y logra graduarse de la Academia después de tres intentos. Durante sus misiones con el mentor Kakashi, no es tan hábil como Sasuke ni tan ingenioso como Sakura. Sin embargo, Naruto introduce un elemento de imprevisibilidad durante las misiones, ya que nunca retrocede en proteger a su equipo o arriesgar su vida.