«¿Puede ejecutar Doom?» (Edición de bacterias intestinales)


Ramlan explica su modelo de visualización de rejilla bacteriana y cómo encaja en el «más amplio».Condenar se basa en todo» tradición.

Aquí en Ars, hemos cubierto versiones de Condenar ejecutándose en todo, desde impresoras pirateadas hasta notepad.exe de Windows y una versión que se ejecuta internamente Condenar sí mismo. Pero estos y otros muchos y variados ejemplos de extrañas Condenar Todas las plataformas carecen de la pura rareza biológica de un nuevo modelo para mostrar el juego usando una cuadrícula de E. coli bacterias.

La estudiante graduada del MIT Lauren Ramlan describe un método para crear lo quijotesco Condenar mostrar en «Píxeles de 1 bit codificados en E. coli para la visualización de medios digitales interactivos», el proyecto final de una clase de Principios de biología sintética. El proyecto de Ramlan se basa en investigaciones anteriores que describen cómo el ADN en E. coli Las bacterias se pueden utilizar para codificar circuitos digitales completos y cómo se puede inducir a las bacterias a emitir fluorescencia como una forma tosca de pantalla digital.

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Agrandar / El tipo de rejilla celular que podría contener un fosforescente. E. coli «mostrar.»

El artículo de Ramlan no se toma la enorme molestia de codificar todo Condenar para ejecutarse en ADN bacteriano, lo que el autor describe como «una hazaña gigantesca que ni siquiera puedo imaginar que se acerque». En cambio, el juego se ejecuta en una computadora estándar, con dispositivos aislados. E. coli celdas en una cuadrícula de micropocillos estándar de 32 × 48 que sirve como una pantalla tosca de baja resolución.

Después de reducir cada fotograma del juego a un mapa de bits en blanco y negro de 32 × 48, Ramlan describe un sistema mediante el cual un controlador de pantalla utiliza un conocido par represor-operador químico para inducir a cada célula individual de la cuadrícula a expresar una proteína fluorescente. O no. La red resultante de bacterias brillantes (que sólo se simula en el proyecto de Ramlan) puede considerarse técnicamente una muestra de Condenar jugabilidad, aunque la falta de sombreado uniforme en escala de grises hace que la imagen resultante sea bastante indescifrable, para ser honesto.

Agrandar / Una imagen del artículo de Ramlan muestra una muestra de la salida (casi indescifrable) de 1 bit y 32 × 48 del modelo.

El tiempo necesario para que todo este proceso se realice también limita la utilidad de la visualización bacteriana teórica. Utilizando un modelo de Python, Ramlan calcula que se necesitarían 8 horas y 20 minutos para que brillara E. coli que la celda «regrese aproximadamente a su estado inicial», incluidos 70 minutos completos para «alcanzar la salida máxima de visualización» durante el ciclo. Eso se traduce en una velocidad de fotogramas de 0,00003 fps que duraría cinco horas. Condenar encontrarse con un trabajo de 599 años más apropiado para la capacidad de atención otorrinolaringológica que para la duración de la vida humana.

Todas esas advertencias se combinan para hacer de esta una de las adiciones más cargadas de tecnicismos al siempre creciente «Condenar funciona en todo». Aún así, el esfuerzo muestra hasta dónde llegarán algunas personas para convertir cualquier cosa en un valor teóricamente Condenar-Pantalla lista. Como escribe Ramlan en su artículo: «Correr Condenartodo lo que uno necesita es una pantalla y fuerza de voluntad.»

Imagen de listado de byfkfkrErbe / Christopher Pooley



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