Joss Whedon es un poco estricto con las reglas, siempre que sean suyas. Tenía una regla sádica cuando escribía para Sarah Michelle Gellar en «Buffy, la cazavampiros», tenía reglas para los vampiros y tenía un conjunto de pautas muy estrictas sobre cómo se debía hacer el programa, lo que llevó infamemente a lo que los miembros del elenco han afirmado que era un conjunto tóxico de «Buffy».
Cuando se trataba de «Los Vengadores», Whedon aparentemente tenía la intención de ser tan exigente con la producción como lo era con su programa de televisión. Aunque comparte el crédito de escritura con Zak Penn, Whedon sostiene que él mismo escribió toda la película. De hecho, le dijo a Thrillist: «Leí [Penn’s script] una vez y no lo he vuelto a ver desde entonces. Yo estaba como, ‘No. No hay nada aquí'». El propio Penn lo confirmó a GQ, diciéndole al medio que Whedon «quería hacerlo a su manera». Parece que el deseo de mantener el control se extendió hasta romper una regla muy importante, ésta establecida por Samuel L. Jackson. .
Como se informó en ese momento, más del 75% de «Los Vengadores» se rodó en los estudios de Albuquerque, que ahora son propiedad de Netflix y desde entonces han albergado producciones de tan alto perfil como «Breaking Bad» y «Logan». «Los Vengadores» utilizó seis de los ocho estudios de sonido del estudio y se rodó en las instalaciones desde noviembre de 2010 hasta agosto de 2011, construyendo algunos decorados enormes que incluían el apartamento de gran altura de Tony Stark y el SHIELD Helicarrier. Fue a través de este amplio set, que abarcaba dos escenarios de sonido, donde se suponía que Samuel L. Jackson debía hacer lo único que le había dicho al director Joss Whedon que no quería hacer: correr.