Tanto Angel como Iceman aparecieron en La serie animada. Angel se fue por razones desconocidas y apareció de manera destacada como uno de los Cuatro Jinetes de Apocalipsis bajo la personalidad de Arkangel. Iceman estaba cansado de ser criticado por Xavier y lo dejó para estar con su novia, Lorna Dane. Su alter ego de Polaris la convierte en un gran nombre.
Hay muchos vacíos en la historia de los X-Men originales, y con al menos tres temporadas de episodios para llenar, al menos un episodio de flashback sería bienvenido. De cualquier manera, X-Men ’97 parece estar preparando el escenario para que personas como Scott y Jean abandonen su membresía.
El equipo de Factor X
El episodio 4 se divide como un homenaje al X Men juego de arcade con Jubilee y Sunspot antes de pasar la historia a Forge y Storm. Esta última se encuentra actualmente sin sus poderes y Forge le ha prometido una posible solución.
Forge menciona su turbio pasado gubernamental y su participación en la creación de inhibidores mutantes. Un Forge arrepentido mira un muro de recuerdos, mostrando una polaroid de su propia época con un equipo mutante. Forge era parte del cómic X-Factor, y en X-Men ’97del mundo, sirvió como miembro de la iteración del “Equipo de Gobierno”.
La fotografía muestra a Forge, Multiple Man, Polaris, Havok, Wolfsbane y Strong Guy, recordando a los espectadores que eran parte de un spin-off clandestino de X-Men. Al igual que en la alineación original de X-Men, estos personajes aparecieron antes y desempeñaron un papel importante en “Cold Comfort” de la temporada 3.
Forge menciona que es un «viejo amigo» de Xavier en X-Men ’97, aunque se sugiere que ya no está con X-Factor. La polaroid de Forge hace referencia a otra división, ya que falta Quicksilver a pesar de ser parte de la pandilla X-Factor en La serie animada.