Cuando escuchas sobre el microbioma intestinal, ¿alguna vez te hace preguntarte qué pequeñas criaturas están pululando dentro de tu propio cuerpo? Como microbiólogo que estudia los microbiomas de plantas, animales y personas, he visto crecer el interés público en los microbios intestinales junto con la investigación sobre su posible influencia dramática en la salud humana. En los últimos años, las técnicas de prueba de microbiomas utilizadas por investigadores como yo ahora están disponibles para los consumidores en el hogar. Estos kits personales de prueba de microbioma intestinal afirman decirle qué organismos viven en su intestino y cómo mejorar su microbioma intestinal utilizando esos datos.
Me interesó mucho cómo funcionan estos kits de prueba caseros, qué tipo de información brindan y si realmente pueden ayudarlo a cambiar su microbioma intestinal. Así que pedí algunos kits de Viome, Biohm y Floré, los probé y revisé mis propios datos de microbioma. Esto es lo que aprendí.
¿Cómo funcionan los kits de microbioma intestinal?
Todos los kits de microbioma intestinal requieren que recopile cuidadosamente la materia fecal fresca. Lo coloca en los diversos tubos proporcionados en el kit y envía las muestras por correo a la empresa. Varias semanas después, recibirá un informe que describe los tipos de microbios que viven en su intestino y sugerencias sobre cómo cambiar su dieta o actividades para alterar potencialmente su microbioma intestinal.
Lo que los consumidores no saben exactamente es cómo las empresas generan los datos del perfil microbiano de su muestra fecal. Un enfoque típico que yo y otros investigadores de microbiomas usamos es extraer y decodificar el material genético microbiano de una muestra. Usamos ese material genético para identificar qué especies de microbios están presentes. El desafío es que este proceso se puede realizar de muchas maneras diferentes, y no existen estándares ampliamente acordados sobre cuál es el mejor método.
Por ejemplo, los análisis de microbiomas se pueden realizar en dos tipos de material genético, ARN o ADN. Si el perfil se basa en el ADN, puede brindarle una instantánea solo de qué tipos de microbios están presentes, no qué genes microbianos están activos o qué actividades están realizando en su cuerpo. Por otro lado, si el perfil se basa en el ARN, puede decirle no solo qué microbios están presentes, sino también si están desempeñando un papel en su digestión o produciendo metabolitos que pueden reducir la inflamación intestinal, entre otras funciones. Viome genera sus perfiles observando el ARN, mientras que las otras empresas utilizan el ADN.
Otras opciones de análisis de datos, como cómo se clasifican los diferentes tipos de secuencias genéticas o qué bases de datos se utilizan para identificar los microbios, también pueden afectar el nivel de detalle y la utilidad de los datos finales. Los científicos de microbiomas suelen ser muy cuidadosos al señalar estos matices cuando interpretan sus propios datos en artículos científicos, pero estos detalles no se presentan claramente en los kits de microbiomas caseros.