Ese juego incluye una misión en la que el jugador se une a Anakin para asaltar el Templo Jedi y masacrar a los Jedi allí (aunque no a los jóvenes). La narración de esa misión muestra que los clones actuaron por lealtad, en lugar de por alguna programación forzada. «Todos sabíamos lo que estaba por pasar, lo que estábamos a punto de hacer», dice la narración. «¿Teníamos alguna duda? ¿Algún pensamiento traidor en privado? Quizás, pero nadie dijo una palabra».
Esto es lo que diferencia ambos enfoques. Que los clones entren en conflicto se suma a la visión de Lucas de las precuelas como una historia sobre el surgimiento de un estado fascista con fanáticos devotos. Los clones, por muy buenos que parecieran, terminaron traicionando a sus amigos y camaradas porque seguían órdenes. «Las Guerras Clon» intentó retener algo de eso haciendo que el chip inhibidor también activara una frase clave en los clones mientras ejecutaban la Orden 66: «Los buenos soldados siguen órdenes». Sin embargo, al convertirlos en dóciles esclavos programados, la franquicia adopta un enfoque más dócil. Por supuesto, dado el grupo demográfico joven del programa y lo queridos que eran los clones, tiene sentido evitar convertirlos en asesinos en frío.
Como dijo Filoni, el chip inhibidor tenía otro objetivo además de simplemente explicar de dónde vino la Orden 66: «También se trataba de mostrar que no todo lo que hizo Palpatine fue perfecto, que hubo casi accidentes, que hubo oportunidades para detenerlo». él.» Esa es la tesis última de las precuelas, particularmente de «Las Guerras Clon». Todo se podría haber evitado si alguien hubiera hecho algunas cosas diferentes. Si tan solo Obi-Wan hubiera tomado en serio la advertencia del Conde Dooku en “El ataque de los clones”. O si Shaak Ti hubiera escuchado a Fives. Quizás todo se podría haber evitado.