Al igual que las otras películas de terror popular de Unholy Trinity, «Witchfinder General» establece escenas de violencia horrible en un contexto pastoral. En la escena inicial, un hombre construye una horca en un campo abierto lista para una bruja condenada mientras Matthew Hopkins de Vincent Price y su asistente sádico John Steame (Robert Russell) observan. Estamos en 1645, y la anarquía de la Guerra Civil en Inglaterra brinda una amplia oportunidad para que hombres como ellos ganen un buen dinero cazando brujas. Mientras la pobre mujer cuelga, se dirigen a su próximo día de pago en el pequeño pueblo de Brandeston en Suffolk.
El joven soldado Roundhead Richard Marshall (Ian Ogilvy) regresa a su casa en el pueblo de permiso para pedir permiso al sacerdote, John Lowes (Rupert Davies), para casarse con su sobrina Sara (Hilary Dwyer). El anciano da su consentimiento, haciendo que Marshall prometa que la llevará a un lugar seguro ya que se han convertido en marginados en la comunidad. Marshall acepta felizmente y se reincorpora a su regimiento.
Mientras tanto, Hopkins y Steame llegan al pueblo para investigar a Lowes, acusado de idolatría y brujería. Intentan forzarle una confesión mediante la tortura, y Sara intenta salvarlo ofreciéndose a Hopkins. Sin embargo, solo logra comprarle a su tío un breve respiro en prisión, ya que Hopkins cambia de opinión después de que Steame la agrede sexualmente. Lowes es ahorcado junto con dos mujeres.
Marshall regresa a Brandeston y jura venganza, colocándolo en un camino infernal que convierte al joven soldado en un hombre vengativo tan violento como sus enemigos. «Witchfinder General» es una historia cruda e inquietante de corrupción, codicia y abuso de autoridad; a diferencia de sus contrapartes ficticias en Unholy Trinity, su poder perturbador deriva de estar basado en hechos reales.