En la edición de septiembre de Empire, Scott insinuó que finalmente tuvo que dejar de dirigir «Blade Runner 2049» debido a un conflicto de programación con «Alien: Covenant» (que debía estar en producción casi al mismo tiempo). «No debería haber tenido que tomar esa decisión», dijo Scott sobre la desafortunada limitación de tiempo. «Pero tenía que hacerlo. Debería haber hecho ‘Blade Runner 2′». Su comentario parece apuntar con el dedo a Warner Bros., lo que implica que ambas imágenes estaban encerradas en una ventana de lanzamiento específica que prevaleció sobre el regreso de Scott para dirigir la secuela. . Las películas finalmente se estrenaron con cinco meses de diferencia, con «Alien: Covenant» llegando en mayo de 2017 seguida de «Blade Runner 2049» en octubre de ese mismo año.
«Alien: Covenant» trató de casar los aspectos de la película slasher en el espacio de «Alien» con una narrativa de ciencia ficción más gótica que involucra al David de Michael Fassbender, pero personalmente no se fusionó del todo. Todavía hubiera sido fascinante ver cómo el enfoque de Scott habría sido diferente al de Villeneuve en «Blade Runner 2049». La simetría de tener a Scott regresando a la silla del director puede incluso haber atraído a más cinéfilos a salir y ver la secuela de «Blade Runner», que no iluminó exactamente la taquilla en su lanzamiento inicial.
Mientras filmaba «Blade Runner 2049», Villeneuve todavía tuvo que lidiar con Scott en el set mirando por encima del hombro como productor ejecutivo. Villaneuve le dijo a IndieWire:
«Me dijo desde el principio que me daría todo el espacio, toda la libertad, se alejaría y esa sería mi responsabilidad, y si lo necesitaba, él estaría al otro lado de la línea. De lo contrario, Estaría solo. Ese fue el mejor regalo que pude recibir, porque nunca hubiera podido trabajar con Ridley detrás de mí».