Por supuesto, ¿quién más sería sino The Shredder? Después de todo, él es el último villano de las tortugas, presentado en el primer número del cómic original de Kevin Eastman y Peter Laird en 1984.
Originalmente, Shredder era el hermano de un ninja que fue asesinado por el dueño de Splinter. Buscando venganza, se une al Clan Foot y entrena para convertirse en un ninja, para poder algún día castigar al asesino de su hermano. En el cómic original, Shredder en realidad muere en el mismo número en el que se presenta (sí, las cosas estaban oscuras en los años 80). Por supuesto, una vez que «Teenage Mutant Ninja Turtles» se convirtió en una gran franquicia, Shredder regresó una y otra vez. Como el principal antagonista de la tortuga, Shredder suele ser humano, pero también ha sido un extraterrestre de Utrom que controla un exotraje humanoide (como la serie animada de 2003) o un demonio literal (como en «Rise of the Teenage Mutant Ninja Turtles»).
En «Mutant Mayhem», no vemos ni escuchamos sobre Shredder o Foot Clan en ningún momento durante el tiempo de ejecución principal de la película, y la película se enfoca en la parte del título del caos mutante. Sin embargo, al final, durante una escena a mitad de los créditos, la ejecutiva del Techno Cosmic Research Institute (TCRI) Cynthia Utrom (con la voz de Maya Rudoph) se da cuenta de que necesitará ayuda para capturar a las tortugas, después de que sus intentos en la primera película no t resultado. Entonces ella llama a Shredder, a quien solo se ve parcialmente mirando la ciudad de Nueva York desde la distancia.